本發(fā)明涉及生物工程,具體涉及一種生產(chǎn)復(fù)蘇促進(jìn)因子rpf的基因工程菌及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、復(fù)蘇促進(jìn)因子(resuscitation?promoting?factor,rpf)是由細(xì)菌自分泌或旁分泌的一類可以促進(jìn)休眠菌復(fù)蘇和生長(zhǎng)的蛋白質(zhì)。該因子最初在藤黃球菌?(micrococcusluteus)中發(fā)現(xiàn),除能促進(jìn)休眠菌的復(fù)活和生長(zhǎng)外,對(duì)正常生長(zhǎng)的細(xì)菌也有效,其機(jī)制可能是參與了細(xì)胞間的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。通過對(duì)該蛋白的結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)及核磁共振分析顯示,其具有一個(gè)高度保守且由70個(gè)左右氨基酸殘基組成的結(jié)構(gòu)域,對(duì)促進(jìn)生長(zhǎng)具有重要意義,即rpf樣結(jié)構(gòu)域。之后在其它革蘭氏陽(yáng)性菌中陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了與此蛋白作用相似,同樣具有rpf樣結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì),組成rpf蛋白家族。
2、中國(guó)發(fā)明專利cn109402032b公開了一種生產(chǎn)復(fù)蘇促進(jìn)因子rpfe的基因工程菌及其應(yīng)用,以嗜聯(lián)苯紅球菌tg9的基因組dna為模板,通過pcr擴(kuò)增rpfe基因;將pcr產(chǎn)物與表達(dá)載體peasy-blunt?e1連接,構(gòu)建重組質(zhì)粒peasy-blunt-rpfe,隨后將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌獲得基因工程菌。該種方法構(gòu)建的基因工程菌提取的重組蛋白純度和酶活性均較低。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明提供了一種生產(chǎn)復(fù)蘇促進(jìn)因子rpf的基因工程菌及其應(yīng)用。本發(fā)明構(gòu)建的基因工程菌提取的重組蛋白純度和酶活性較高。
2、本發(fā)明采用以下技術(shù)方案:
3、本發(fā)明提供了一種生產(chǎn)復(fù)蘇促進(jìn)因子rpf的基因工程菌,其特征在于,所述基因工程菌屬于原核生物,所述基因工程菌的核苷酸序列如seq?id?no.1所示,該序列為將藤黃微球菌(micrococcus?luteus)野生型細(xì)菌復(fù)蘇促進(jìn)因子(resuscitation-promotingfactor,?rpfwt)原始核苷酸序列(z96935.2:920-1591)經(jīng)過密碼子突變和dna序列優(yōu)化后獲得,將所述核苷酸序列命名為delta?rpf,所述原始核苷酸序列如seq?id?no.2所示。
4、seq?id?no.1:
5、atggataccatgaccctgtttaccaccagcgcaacccgtagccgccgtgcaacagcgagcattgtggcaggcatgaccctggcgggtgccgcagccgtgggctttagcgcgccggcacaggcggcgaccgttgatacctgggaccgcctcgccgaatgcgaatcaaatggtacctgggatatcaacacgggtaacggtttttacggtggcgttcaatttaccctgagcagctggcaggccgttggaggtgaaggctacccgcatcaggcgtcaaaagccgaacagatcaaacgtgccgaaatcctgcaagatctgcagggctggggcgcctggccgctatgtagtcagaaactgggtctgacccaggcggatgcagatgcaggcgatgtggatgccaccgaagccgcgccggtcgccgtcgaacgcaccgccaccgttcagcgtcagtcagccgcggatgaagccgcagcggaacaggcggcggcagcggagcaggccgtcgttgccgaagcggaaaccattgtcgttaaaagcggcgatagcctgtggaccctggcgaacgaatatgaagtggaaggtggctggaccgcgctgtacgaagcgaataaaggtgcagttagcgacgcggccgttatttatgcgggccaggaactggtgttaccgcaggcgtaa。
6、seq?id?no.2:
7、atggacaccatgactctcttcaccacttccgccacccgctcccgccgtgccaccgcctcgatcgtcgcgggcatgaccctcgccggcgccgccgccgtgggcttctccgccccggcccaggccgccaccgtggacacctgggaccgcctcgccgagtgcgagtccaacggcacctgggacatcaacaccggcaacggcttctacggcggcgtgcagttcaccctgtcctcctggcaggccgtcggcggcgaaggctacccgcaccaggcctcgaaggccgagcagatcaagcgcgccgagatcctccaggacctgcagggctggggcgcgtggccgctgtgctcgcagaagctgggcctgacccaggctgacgcggacgccggtgacgtggacgccaccgaggccgccccggtcgccgtggagcgcacggccaccgtgcagcgccagtccgccgcggacgaggctgccgccgagcaggccgctgccgcggagcaggccgtcgtcgccgaggccgagaccatcgtcgtcaagtccggtgactccctctggacgctcgccaacgagtacgaggtggagggtggctggaccgccctctacgaggccaacaagggcgccgtctccgacgccgccgtgatctacgtcggccaggagctcgtcctgccgcaggcctga。
8、進(jìn)一步的,所述基因工程菌保藏于中國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心,保藏地址為中國(guó)武漢,保藏日期為2025年11月07日,保藏編號(hào)為cctcc?no:m?20252480,分類命名為大腸埃希氏菌pet32a-delta?rpf-bl21(de3)?escherichia?coli?pet32a-delta?rpf-bl21(de3)。
9、本發(fā)明還提供了上述生產(chǎn)復(fù)蘇促進(jìn)因子rpf的基因工程菌的應(yīng)用。
10、進(jìn)一步的,制備rpf重組蛋白,包括如下步驟:
11、s1、復(fù)蘇促進(jìn)因子delta?rpf基因的合成及基因工程菌的構(gòu)建;
12、s2、復(fù)蘇促進(jìn)因子delta?rpf基因工程菌的表達(dá)、純化;
13、s3、取步驟s2中所得的上清液進(jìn)行sds-page電泳分析;
14、s4、表達(dá)菌株的大量誘導(dǎo)與delta?rpf重組蛋白的純化;
15、s5、檢測(cè)delta?rpf重組蛋白的酶活力。
16、進(jìn)一步的,所述s5步驟中,用4-甲基傘形酮-n-乙酰-β-d-氨基葡萄糖苷(4-muf-3-nag)作為底物,建立酶活性測(cè)定方法,用于檢測(cè)delta?rpf重組蛋白的酶活力。
17、進(jìn)一步的,所述建立酶活性測(cè)定方法,包括如下步驟:
18、s51、配制4-muf-3-nag工作液;
19、s52、測(cè)定delta?rpf重組蛋白的濃度與delta?rpf重組蛋白產(chǎn)量;
20、s53、稀釋delta?rpf重組蛋白,隨后加入所述4-muf-3-nag工作液,孵育,加入堿溶液,得到混合液;
21、s54、對(duì)所述混合液進(jìn)行酶活性的檢測(cè)。
22、進(jìn)一步的,所述s51中4-muf-3-nag工作液的配制具體包括:吡啶:水(1:1)的混合溶液溶解4-muf-3-nag,至4-muf-3-nag的濃度為5?mg/ml,得到4-muf-3-nag貯存溶液;
23、隨后使用檸檬酸鈉混合水溶液稀釋4-muf-3-nag貯存溶液濃度至16?μmol/l,得到4-muf-3-nag工作液。
24、進(jìn)一步的,所述檸檬酸鈉混合水溶液為:50mmol/l?檸檬酸鈉,5mmol/l?mgso4進(jìn)行混合,調(diào)整ph為6.0。
25、本發(fā)明具有以下技術(shù)效果:
26、本發(fā)明通過對(duì)藤黃微球菌delta?rpf氨基酸序列進(jìn)行突變,通過基因合成構(gòu)建重組質(zhì)粒,經(jīng)轉(zhuǎn)化大腸埃希氏桿菌感受態(tài)細(xì)胞后構(gòu)建基因工程菌,進(jìn)而制備delta?rpf?重組蛋白,制備完成的delta?rpf重組蛋白呈可溶性表達(dá),為后續(xù)檢測(cè)vbnc狀態(tài)腸炎沙門氏菌、vbnc狀態(tài)大腸埃希氏菌、vbnc狀態(tài)金黃色葡萄球菌、vbnc志賀氏菌和vbnc狀態(tài)李斯特氏菌等微生物奠定了良好研究基礎(chǔ)。經(jīng)親和層析對(duì)重組蛋白進(jìn)行純化后,delta?rpf重組蛋白的純度可達(dá)93%,遠(yuǎn)高于現(xiàn)有技術(shù)提取的蛋白純度。
27、本發(fā)明構(gòu)建的基因工程菌制備的delta?rpf重組蛋白酶活力顯著高于未突變的rpf蛋白酶活性。